Österreich

Die ersten 21 Etappen führen den Wanderer von der Kaiser-Franz-Josefs-Höhe unterhalb des Großglockners bis zur Baumgartner Höhe oberhalb des Faaker Sees, wo man die Grenze zu Slowenien überquert. Unterwegs durchquert man die Nationalparks Hohe Tauern und Nockberge und wandert entlang mehrerer Kärntner Seen (Millstätter See, Ossiacher See und Wörthersee).

Slowenien

Die nächsten 6 Etappen des Weges führen durch Slowenien. Von Kranjska Gora durchquert man den in den Julischen Alpen gelegenen Nationalpark Triglav, folgt dem Lauf der Soča, bis man auf alten Militärpfaden, in der Nähe von Tolmin die Grenze zu Italien erreicht.

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  Die Quelle der Soča ist nahe am Soča-Trail (Etappe 24 des Alpe Adria Trail), muss jedoch nicht besucht werden.
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  Nahe bei Trenta
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  Ein Stück des Weges führt an der Straße 206 entlang
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  Die Soča wird regelmäßig überquert
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  Die Berge sind immer zu sehen

Italien

Die letzten Etappen des Alpe Adria Trails führen weitestgehend durch Italien, mit kurzen Abstechern nach Slowenien. Durch das Natisone-Tal erreicht man Cividale del Friuli. Von dort wendet sich der Wanderweg nach Süden und durchquert das Weinbaugebiet Collio, die Karstlandschaft nördlich von Triest, passiert noch einmal die Grenze nach Slowenien, um in Lipica Station zu machen, bevor der Weg schließlich in Muggia an der Adria endet.

Variante 3-Länder-Rundtour

In sieben Tagesetappen geht es vom Faaker See in Kärnten über Tarvisio in Friaul-Julisch Venetien und Planica in Slowenien zurück nach Österreich.