Bischof von Brünn

Nach dem Tod des ersten Brünner Bischofs Matthias Franz Chorinský von Ledska nominierte der Kaiser am 7. Dezember 1786 Johann Baptist Lachenbauer zu dessen Nachfolger. Der päpstlichen Bestätigung vom 29. Januar 1787 folgte am 22. Februar d. J. in Wien die Bischofsweihe durch Kardinal Christoph Anton Migazzi und die Inbesitznahme des Bistums am 23. Mai d. J.

Lachenbauer war ein Anhänger der josephinischen Reformen und berief 1789 den ehemaligen Klosterbrucker Prämonstratenser Georg Norbert Korber, der wegen seiner kirchenpolitischen Auffassungen mit seinem Stift in Konflikt geraten war, zum bischöflichen Rat und Sekretär. Zudem umgab er sich mit weiteren Reformkatholiken, mit deren Hilfe er sein Bistum zu einem josephinischen Musterbistum umgestalten wollte. 1790 verweigerte er den übrigen österreichischen Bischöfen, die eine Aufhebung der Generalseminare forderten, die Unterstützung. Wohl deshalb ernannte ihn der Kaiser zum „Wirklichen Geheimen Rat“.

Während seiner Amtszeit wurde der Brünner Dom im Stil des Barock umgestaltet. Mit dem Olmützer Erzbischof Anton Theodor von Colloredo-Waldsee-Mels konnte er eine Einigung über die Verwaltung des bischöflichen Dotationsgutes Chirlitz erzielen.