Die Diözese Linz ist in folgende 39 Dekanate und 487 Pfarren unterteilt:

• Dekanat Altenfelden
  • Aigen im Mühlkreis, Altenfelden, Arnreit, Haslachh an der Mühl, Kirchberg an der Donau, Klaffer, Kleinzell, Neufelden, Obermühl, Oepping, Rohrbach, Schwarzenberg, St. Oswald bei Haslach, Ulrichsberg
• Dekanat Altheim
  • Altheim, Antiesenhofen, Geinberg, Gurten, Kirchdorf am Inn, Lambrechten, Mörschwang, Mühlheim am Inn, Münsteuer, Obernberg am Inn, Ort im Innkreis, Polling, Reichersberg, Senftenbach, St. Georgen bei Obernberg, Weilbach
• Dekanat Andorf
  • Altschwendt, Andorf, Diersbach, Eggerding, Enzenkirchen, Kopfing, Raab, Rainbach im Innkreis, Sigharting, St. Willibald, Taufkirchen an der Pram, Zell an der Pram
• Dekanat Aspach
  • Aspach, Höhnhart, Mettmach, Mossbach, Roßbach, St. Johann am Walde, Treubach, Weng im Innkreis
• Dekanat Bad Ischl
  • Bad Goisern, Bad Ischl, Ebensee, Gosau, Hallstatt, Lauffen, Obertraun, Pfandl, Roith, St. Wolfgang
• Dekanat Braunau
  • Braunau-Maria Königin, Braunau-Ranshofen, Braunau-St. Franziskus, Braunau-St. Stephan, Burgkirchen, Gilgenberg, Handenberg, Mauerkirchen, Mining, Neukirchen an der Enknach, Schwand im Innkreis, St. Georgen am Fillmannsbach, St. Peter am Hart, Überackern
• Dekanat Eferding
  • Alkoven, Aschach an der Donau, Eferding, Haibach an der Donau, Hartkirchen, Maria Scharten, Prambachkirchen, Schönering, St. Marienkirchen an der Polsenz, Stroheim
• Dekanat Enns-Lorch
  • Asten, Enns-St. Laurenz, Enns-St. Marien, Hargelsberg, Hofkirchen im Traunkreis, Kronstorf, Niederneukirchen, St. Florian bei Linz, St. Marien, Weichstetten
• Dekanat Frankenmarkt
  • Fornach, Frankenburg, Frankenmarkt, Mondsee, Neukirchen an der Vöckla, Oberhofen, Oberwang, Pöndorf, St. Georgen im Attergau, Vöcklamarkt, Weißenkirchen im Attergau, Zell am Moos, Zipf
• Dekanat Freistadt
  • Freistadt, Grünbach, Gutau, Hirschbach, Kefermarkt, Lasberg, Leopoldschlag, Neumarkt im Mühlkreis, Rainbach im Mühlkreis, Reichenthal, Sand, Schenkenfelden, St. Oswald bei Freistadt, Waldburg, Windhaag bei Freistadt
• Dekanat Gallneukirchen
  • Alberndorf, Altenberg bei Linz, Eidenberg, Feldkirchen an der Donau, Gallneukirchen, Goldwörth, Gramastetten, Hellmonsödt, Kirchschlag, Lacken, Ottensheim, Reichenau, St. Gotthard, Steyregg, Treffling, Walding
• Dekanat Gaspoltshofen
  • Aichkirchen, Aistersheim, Altenhof am Hausruck, Bachmanning, Gaspoltshofen, Geboltskirchen, Haag am Hausruck, Lambach, Meggenhofen, Neukirchen bei Lambach, Offenhausen, Pennewang, Stadl-Paura, Steinerkirchen am Innbach, Weibern
• Dekanat Gmunden
  • Altmünster, Bad Wimsbach-Neydharting, Gmunden, Gmunden-Ort, Gschwandt bei Gmunden, Laakirchen, Lindach, Neukirchen bei Altmünster, Ohlsdorf, Pinsdorf, Roitham, Steyrermühl, Traunkirchen
• Dekanat Grein
  • Bad Kreuzen, Dimbach, Grein, Klam, Pabneukirchen, Saxen, St. Georgen am Walde, St. Nikola an der Donau, St. Thomas am Blasenstein, Waldhausen
• Dekanat Kallham
  • Dorf an der Pram, Gallspach, Grieskirchen, Hofkirchen an der Trattnach, Kallham, Neumarkt am Hausruck, Pollham, Pram, Riedau, Rottenbach, St. Georgen bei Grieskirchen, Taufkirchen an der Trattnach, Wendling
• Dekanat Kremsmünster
  • Adlwang, Allhaming, Bad Hall, Eggendorf, Kematen an der Krems, Kremsmünster, Neuhofen an der Krems, Pfarrkirchen bei Bad Hall, Ried im Traunkreis, Rohr, Sattledt, Sipbachzell, Wartberg an der Krems
• Dekanat Linz-Mitte
  • Linz-Dompfarre, Linz-Don Bosco, Linz-Heilige Familie, Linz-St. Konrad, Linz-St. Margarethen, Linz-St. Matthias, Linz-St. Severin, Linz-Stadtpfarre
• Dekanat Linz-Nord
  • Linz-Christkönig, Linz-Heiliger Geist, Linz-Pöstlingberg, Linz-St. Leopold, Linz-St. Magdalena, Linz-St. Markus, Linz-Stadtpfarre Urfahr, Puchenau
• Dekanat Linz-Süd
  • Linz-Marcel Callo (Auwiesen), Linz-Ebelsberg, Linz-Guter Hirte, Linz-Herz Jesu, Linz-Hlgst. Dreifaltigkeit, Linz-St. Antonius, Linz-St. Franziskus, Linz-St. Michael, Linz-St. Paul zu Pichling, Linz-St. Peter, Linz-St. Quirinus, Linz-St. Theresia
• Dekanat Mattighofen
  • Auerbach, Feldkirchen bei Mattighofen, Friedburg, Jeging, Kirchberg bei Mattighofen, Lengau, Lochen, Maria Schmolln, Mattighofen, Munderfing, Palting, Perwang, Pfaffstätt, Pischelsdorf, Schalchen, Schneegattern, Uttendorf-Helpfau
• Dekanat Molln
  • Frauenstein, Grünburg, Leonstein, Molln, Steinbach an der Steyr, Waldneukirchen
• Dekanat Ostermiething
  • Eggelsberg, Franking, Geretsberg, Haigermoos, Hochburg, Maria Ach, Moosdorf, Ostermiething, Riedersbach, St. Pantaleon, St. Radegund, Tarsdorf
• Dekanat Perg
  • Allerheiligen, Arbing, Baumgartenberg, Mauthausen, Mitterkirchen, Münzbach, Naarn, Perg, Pergkirchen, Rechberg, Schwertberg, Windhaag bei Perg
• Dekanat Pettenbach
  • Eberstalzell, Fischlham, Grünau, Kirchham bei Gmunden, Madgalenaberg, Pettenbach, Scharnstein, St. Konrad, Steinerkirchen an der Traun, Viechtwang, Vorchdorf
• Dekanat Peuerbach
  • Engelhartszell, Heiligenberg, Michaelnbach, Natternbach, Neukirchen am Walde, Peuerbach, Pötting, St. Aegidi, St. Agatha, St. Thomas bei Waizenkirchen, Stadl-Kicking, Waizenkirchen, Waldkirchen am Wesen, Wesenufer
• Dekanat Pregarten
  • Bad Zell, Hagenberg, Katsdorf, Pregarten, Ried in der Riedmark, St. Georgen an der Gusen, Tragwein, Wartberg ob der Aist
• Dekanat Ried im Innkreis
  • Andrichsfurt, Aurolzmünster, Eberschwang, Eitzing, Geiersberg, Hohenzell, Kirchheim im Innkreis, Lohnsburg, Mehrnbach, Neuhofen im Innkreis, Pattigham, Peterskirchen, Pramet, Ried im Innkreis, Riedberg, Schildorn, St. Marienkirchen am Hausruck, St. Martin im Innkreis, Taiskirchen, Tumeltsham, Utzenaich, Waldzell, Wippenham
• Dekanat Sarleinsbach
  • Altenhof im Mühlkreis, Hofkirchen im Mühlkreis, Julbach, Kollerschlag, Lembach, Neustift im Mühlkreis, Niederkappel, Oberkappel, Peilstein, Pfarrkirchen im Mühlkreis, Putzleinsdorf, Rannariedl, Sarleinsbach
• Dekanat Schärding
  • Brunnenthal, Esternberg, Freinberg bei Schärding, Münzkirchen, Schardenberg, Schärding, St. Florian am Inn, St. Marienkirchen bei Schärding, St. Roman, Suben, Vichtenstein, Wernstein
• Dekanat Schörfling
  • Abtsdorf, Attersee, Aurach am Hongar, Gampern, Lenzing, Nußdorf am Attersee, Schörfling, Seewalchen, Steinbach am Attersee, Unterach am Attersee, Weyregg am Attersee
• Dekanat Schwanenstadt
  • Ampflwang, Attnang, Atzbach, Bach, Bruckmühl, Desselbrunn, Maria Puchheim, Niederthalheim, Ottnang, Puchkirchen am Trattberg, Regau, Rüstorf, Schwanenstadt, Timelkam, Ungenach, Vöcklabruck, Wolfsegg, Zell am Pettenfirst
• Dekanat Steyr
  • Aschach an der Steyr, Dietach, Garsten, Kleinraming, Maria Laah, Schiedlberg, Sierning, Sierninghofen-Neuzeug, St. Ulrich bei Steyr, Steyr-Christkindl, Steyr-Ennsleite, Steyr-Gleink, Steyr-Heilige Familie, Steyr-Münichholz, Steyr-Resthof, Steyr-St. Anna, Steyr-St. Michael, Steyr-Stadtpfarre, Wolfern
• Dekanat St. Johann am Wimberg
  • Bad Leonfelden, Helfenberg, Herzogsdorf, Niederwaldkirchen, Oberneukirchen, St. Johann am Wimberg, St. Martin im Mühlkreis, St. Peter am Wimberg, St. Stefan am Walde, St. Veit im Mühlkreis, Traberg, Vorderweißenbach, Waxenberg, Zwettl
• Dekanat Traun
  • Ansfelden, Berg an der Krems, Dörnbach, Haid, Hörsching, Kirchberg bei Linz, Langholzfeld, Leonding, Leonding-Doppl-Bruder Klaus, Leonding-Hart-St. Johannes, Oftering, Pasching, Pucking, Traun, Traun-Oedt-St. Josef, Traun-St. Martin, Wilhering
• Dekanat Unterweißenbach
  • Kaltenberg, Königswiesen, Liebenau, Mönchdorf, Pierbach, Schönau im Mühlkreis, St. Leonhard bei Freistadt, Unterweißenbach, Weitersfelden
• Dekanat Wels-Land
  • Bad Schallerbach, Buchkirchen bei Wels, Gunskirchen, Holzhausen, Krenglbach, Marchtrenk, Pichl bei Wels, Schleißheim, Steinhaus, Thalheim bei Wels, Wallern, Weißkirchen bei Wels
• Dekanat Wels-Stadt
  • Wels-Heilige Familie, Wels-Herz-Jesu, Wels-St. Franziskus, Wels-St. Josef, Wels-St. Stephan, Wels-Stadtpfarre
• Dekanat Weyer
  • Gaflenz, Großraming, Kleinreifling, Laussa, Losenstein, Maria Neustift, Reichraming, Ternberg, Weyer
• Dekanat Windischgarsten
  • Heiligenkreuz, Hinterstoder, Kirchdorf an der Krems, Klaus, Micheldorf, Nussbach, Schlierbach, Spital am Pyhrn, St. Pankraz, Steinbach am Ziehberg, Steyrling, Vorderstoder, Windischgarsten